1、對象不同

認證的對象是產品、服務和管理體系(包括質量管理體系、環境管理體系、職業健康安全管理體系)，面向的是需要進行認證審核的各類組織(企業或其他機構)。

而認可的對象是認證機構、檢查機構、實驗室和認證培訓機構以及從事審核、評審等認證活動的人員。

2、性質不同

認可機構(例如CNAS)：必須經政府部門授權，其認可活動受到政府部門直接的監督與管理，其認可結果得到政府和社會的普遍承認。

認證機構(例如第三方檢測認證機構)：完全獨立、公正的第三方機構，是以營利為目的，幫助需要認證的組織按認證標準建立一套符合標準要求的管理體系。認證機構對有關產品、服務等進行認證合格后，應當頒發認證標志。這種標志類似于商標一樣，受商標法的保護。(如綠色產品認證)

3、依據不同

認證的依據是相關技術規范、相關技術規范的強制性要求或標準。如IS0900l：2000, IS014001.

認可的依據是認可準則與認可程序和有關法律、法規。

4、級別不同

認證機構實施認證的能力，需要得到認可機構的認可。例如第三方檢測機構需要獲得CNAS認可。

認證與認可都是合格評定活動。認證的結果是給予書面保證，最終由認證機構出具認證證書以表示企業的管理體系或產品質量符合認證標準的要求。認可的結果是給予正式承認，認可是證明具備某種資格和能力，認可的最終結果要由認可機構出具認可證書。

認證機構要定期或不定期地接受認可機構的監督檢查，對檢查不合格的認證機構，認可機構有權要求認證機構限期整改。對不能滿足技術規范或認證標準的組織有權暫停直至撤銷該認證證書。